您的瀏覽器版本太低

請升級您的瀏覽器:Internet Explorer11 或以下瀏覽器: Firefox / Chrome / 360極速瀏覽器

病理機制

  病理機制

病理機制案例展示

案例分析一(團隊成員發表)

DNA甲基化和羥甲基化揭示ECM1ATF5EOMES在肝癌中的抑癌作用

Integrated analyses of DNA methylation and hydroxymethylation reveal tumor suppressive roles of ECM1, ATF5, and EOMES in human hepatocellular carcinoma. Genome Biol. 2014;3;15(12):533.(IF=11.313)

一、研究背景

腫瘤抑制基因的高甲基化參與了肝癌的發病機制, 由于傳統亞硫酸鹽測序檢測的是5mC5hmC的混合信號, 因此同時檢測5mC5hmC可能會更準確的發現異常甲基化基因。

二、研究方法

1、取材:8對肝癌與癌旁組織

2、測序:羥甲基化和甲基化標簽測序(HMST-seq)

轉錄組測序(RNA-Seq)

3、驗證:UPLCMS/MS: 整體甲基化/羥甲基化

         高通量BSP: 差異甲基化

RTq-PCR: 基因表達差異

4、功能:Knockdown敲低: ECM1ATF5EOMES

三、研究結果

1) UPLC-MS/MS檢測出整體的5mC5hmCHCC中降低;

2) HMST-seq檢測在CCGG位點, HCC5mC水平增加, 5hmC水平降低;

3) 富集通量分析揭示差異甲基化基因和羥甲基化基因富集與癌癥相關通路;

4) 高通量、RTqPCR及細胞功能實驗證實ATF5ECM1EOMESHCC中受甲基化抑制,并且具有抑癌基因作用。

四、研究結論

我們發現癌癥信號通路上的基因發生大量的甲基化或者羥甲基化異常,其中ECM1ATF5EOMES經細胞實驗證實具有潛在的抗癌功能。

 

         


圖1. 基因組區域內5mC和5hmC的相對密度                                                          圖2. DMR和DhMR的分布

                   


              圖3. 癌癥途徑中的基因表達及甲基化變化                                        圖4. siRNA敲低ATF5、ECM1、EOMES對肝癌細胞生長的影響

 

案例分析二

慢性病患者的縱向DNA系統動力學

Longitudinal personal DNA methylome dynamics in a human with a chronic condition. Nat Med. 2018;24(12):1930-1939.(IF=32.621)

一、研究背景

表觀基因組學調節基因表達,在精確的個人健康方面與基因組學一樣重要,因為它嚴重受環境和生活方式的影響。目前,基于多組學技術對健康個體的研究較為稀缺。研究組學數據在時間維度的動態變化的研究更為罕見。個體甲基化圖譜在不同生理狀態和健康狀態的變化也處于未知狀態

二、研究方法

1、取材:一個個體不同時間點外周血單核細胞

2、測序:全基因組甲基化測序(WGBS, n=28)

轉錄組測序(RNA-Seq, n=57)

3、驗證:

4、功能:

三、研究結果

1) 通過單個健康個體多時間的甲基化組和轉錄組數據,揭示了甲基化組數據與個體的慢性疾病相關,例如血糖波動; 而轉錄組數據與急性感染更為相關;

2) DNA甲基化在血糖實際升高80-90天以前出現顯著變化,暗示甲基化或許可以協助監測糖尿病,甚至早期檢測或預防糖尿病;

3) 基于超深的甲基化測序數據,發現了數量空前的等位特異性差異甲基化區域,并發現其可能與等位特異性基因的表達調控相關。

四、研究結論

不同類型的“組學”數據的變化與個體的不同生理方面有關:DNA甲基化與慢性疾病關聯, 轉錄組與急性事件更關聯。

    

圖1. 不同時間段甲基化組和轉錄組圖                               2. 全基因組甲基化的動態圖譜圖                                 3. 感染過程中基因表達的變化



    



圖4. 基因組甲基化改變與葡萄糖水平變化有關        圖5. 病毒感染過程中與葡萄糖升高和差異表達基因相關的差異甲基化位點的注釋                圖6. 等位基因特異性甲基化


關于我們
公司介紹
合作伙伴
加入我們
聯系我們
新聞中心
市場活動
企業新聞
科技服務
DNA甲基化測序
轉錄組測序
DNA-蛋白互作測序
DNA甲基化解決方案

聯系我們

Contact Us

深圳市艾斯基因科技有限公司

地址:深圳市龍崗區立信路43號永昌大廈206室

電話:0755-2850-7994 手機:18665353180

郵箱:support@sz-acegen.com

Copyright ? 2016-2020 sz-acegen.com 粵ICP備16072881號 技術支持:洛壹網絡

一级黄色录像影片 夫妻性生活影片 免费在线观看 一级a做爰片